Dostęp do danych mają wyłącznie zalogowani użytkownicy aplikacji, znający login, aktualne hasło i posiadający dostęp do tokenu SMS. Połączenie między użytkownikiem i serwerami jest zabezpieczone protokołem SSL (podobnie jak w banku), a dane są zaszyfrowane. Pracownicy MEDchart nie mają do nich dostępu.